SpecOpt：基于接触差异推理的 Agent 分子特异性结合优化框架
英文标题：SpecOpt: Contact-Diff Reasoning for Agentic Molecule Optimization Toward Binding Specificity
小分子药物的脱靶蛋白结合是引发药物不良反应的主要根源，但现存基于结构的分子设计方法多偏向于从头（de novo）生成选择性化合物，忽视了对已有成熟配体特异性的定向优化。为此，研究团队提出 SpecOpt 框架，结合“接触差异推理”（Contact-Diff Reasoning）赋能 Agent 开展分子优化，显著改善分子的结合特异性。该成果为 AI 辅助药物研发（AIDD）提供了全新的 Agent 式优化范式，有助于降低后期临床脱靶毒性风险。
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中文
论文信息与摘要
arXiv:2609.21165v1 [Announce Type: new]
摘要：脱靶蛋白结合是小分子药物引发不良反应的主要来源，然而目前大多数基于结构的分子设计方法往往侧重于从头（de novo）生成具有选择性的化合物，而非对已有、且已充分表征的化合物进行结合选择性的定向优化……
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